נמלטים עונה 2 I נמלטים עונה שניה
נמלטים עונה 2 מתחילה בכך שהיא מראה את סיום הבריחה הגדולה מכלא פוקס ריבר ומאותו הרגע שלטונות החוק רודפים אחרי שמונת הנמלטים אשר הצליחו לברוח מייקל סקופילד, לינקולן בורוז, פרננדו סוקרה, ג'ון אברוצי, בנג'מין "סי־נוט" פרנקלין, תיאודור "טי־באג" באגוול, דייוויד "טווינר" אפולסקיס, וצ'ארלס "הייוואייר" פאטושיק. בראש שלטונות החוק נמצא הסוכן הפדרלי אלכסנדר מהון אשר מחליט שהוא רוצה להיות זה שיצליח לתפוס את הנמלטים, ומי שהכי חשוב לו הם האחים מייקל סקופילד ולינקולן בורוז. מפרק לפרק מהון מבין שהקעקועים שעל גופו של מייקל בעצם קשורים לבריחה ומפעם לפעם הוא עולה על עוד חלק בתוכנית ומצליח להתקרב למחבואם של האחים. רוב משמונת הנמלטים מנסים לחזור לחיים שהיו להם לפני שהם נכנסו לכלא, חלקם חוזרים אפילו לאותה העיר וכמובן גם פוגשים את יקיריהם. כמובן שהחיים החדשים לאחר הבריחה מאוד לא דומים לאלה שהיו לפני הכלא מפני שהם צריכים להיזהר בכל מקום שהם הולכים אליו בגלל שהמשטרה פרסמה את תמונתם של שמונת הנמלטים וישנו פרס למי שימצא אותם. ולכן הם צריכים לחשוב פעמיים על כל פעולה שהם עושים ולנסות כמה שפחות להיראות בפומבי ולסכן את חירותם. למרות שכל אחד מנמלטי הכלא הולך למקום אחר עדיין כולם חושבים על אותו הדבר והוא 5 מיליון הדולר ש צ'רלס ווסטמורלנד החביא ביוטה ולכן כולם מחליטים להגיע לשם ולחפש את הכסף. החיפוש הזה סיבך לא מעט מהנמלטים אשר גרם להם להיתפס ולחזור שוב לכלא. גם הסוכן הפדרלי אלכסנדר מהון אשר הבין שהאחים ושאר הנמלטים יגיעו ליוטה כדי לחפש את הכסף מצא את עצמו מוחזק ע"י השוטרים ביוטה אחרי שהאחים הפלילו אותו באחזקת סמים. ולכן חלקם לא היו ברי מזל ובאמת נתפסו על ידי המשטרה והוכנסו שוב לכלא. החלק הדרמטי ביותר בנמלטים עונה שניה הוא הפרק האחרון בו מייקל סקופילד, טי באג, בראד בליק ואלכסנדר מהון מוצאים את עצמם בתוך כלא מסתורי בשם "סונה". "סונה" אינו מזכיר שום כלא אחר ובמיוחד לא את פוקס ריבר. זהו כלא שמכיל בתוכו את הפושעים הכי גדולים. אפילו הסוהרים שצריכים לשמור על הסדר בכלא הרימו ידיים והחליטו שהם לא מתערבים יותר בארגון הכלא. השליטה בכלא הועברה לאסיר בשם לצ'רו אשר השליט סדר והיה המפקד החדש שם. הוא זה שקבע את החוקים וכל האסירים היו צריכים לציית להם.